вопрос, можно ли опубликовать базу на веб-сервере если 1С сервер и веб-сервер это две разные машины ?

думаю, что да

зависит от настройки вед-сервера ?

а как это сделать? ведь при публикации из конфигуратора нет возможности указать айпишник веб-сервера, видит только локальные или нужно конфиги сервера руками править?

что-то при быстром поиске в 8.2.Руководство администратора.PDF не могу найт

(3) КОнфиги править и установить компоненты работы с веб сервером.

Есть еще утилита webinst

А по-моему нельзя. Нужно чтобы Сервер стоял физически на той машине, где стоит веб-сервер.