Почему на запускаются регламентные задания. Поставил через каждые 10 сек. Сделал его предопределенным чтобы не надо было запускать принудительно но все равно не запускается.

В чем может быть проблема

да там миллион причин может быть. Ты поконкретней спрашивай.

Нужно ли в процедура прописывать приНачалеРаботыСистемы что нибудь

Что за конфа?

Самописка

Посмотри, как сделано в типовых. По-моему прописывается только для файлового варианта

В типовой бухии нашел:
   // автообмен данными
   Если глЗначениеПеременной("глОбработкаАвтоОбменДанными") <> Неопределено Тогда
       
       // подключим обработчик обменов данными
       ПодключитьОбработчикОжидания("ПроверкаОбменаДанными", глЗначениеПеременной("глКоличествоСекундОпросаОбмена"));
           
   КонецЕсли;

поройся там

Вот у меня как раз файловый вариант.