Можно как нибудь через виртуальную таблицу $РегистрОстаткиОбороты вытащить остатки на начало/конец, а приход/расход с фильтром по реквизиту регистра или таки придется корячится самому?

Придется корячится самому.

Нет там фильтров по реквизиту...

Всем спасибо я так и думал.