Собственно, один и тот же документ под одним и тем же пользователем проводится в файловой базе и не проводится в sql. по отладчику не доходит даже до обработки проведения, где то на подписках застревает.
Да, такое бывает. Каких прав не хватает, можно увидеть в журнале регистрации. отладчик поможет только, если идет в коде обращение к какому-нибудь объекту, и не хватает прав... Но это маловероятная ситуация. Скорее всего дело в запросах РЛС.