Есть такие регистры (упрощенно):

ЕдиницыИзмерения (измерение : номенклатура; ресурс : кратность)
КурсыВалют (измерение : валюта; ресурс : курс,кратность)
ЦеныНоменклатуры (измерение : Товар,ТипЦены; ресурс : Цена,Валюта,ЕдИзм)

Цены номенклатуры забиты в разных валютах.
На складе все хранится, в базовых единицах, цены забиты за разные единицы.  

Сделать отчет стоимостной оценки склада в пересчете в разные валюты.
т.е. пользователь выбирает тип цен и валюту, оно пересчитанную цену товара умножает на количество.

Можно-ли такой отчет сделать на СКД? чтобы доступны были все прелести в настройках типа отборы и группировки по складах, иерархии и т.п.

в скд все можно..
если кто против, присылай))..

Запрос сильно сложный получится?

нет..
на самом деле, нужно хотя бы самый простой запрос написать, и потратить на его настройку пару тройку дней.. эффект потрясающий..
а построитель всегда был уаном))