В запросе

   ВЫБОР
       КОГДА ЕСТЬNULL(ШтатноеРасписаниеОрганизацийСрезПоследних1.КоличествоСтавок, 0) - ЕСТЬNULL(ШтатноеРасписаниеОрганизацийСрезПоследних.КоличествоСтавок, 0) > 0
           ТОГДА ЕСТЬNULL(ШтатноеРасписаниеОрганизацийСрезПоследних1.КоличествоСтавок, 0) - ЕСТЬNULL(ШтатноеРасписаниеОрганизацийСрезПоследних.КоличествоСтавок, 0)
       ИНАЧЕ ЕСТЬNULL(ШтатноеРасписаниеОрганизацийСрезПоследних.КоличествоСтавок, 0) - ЕСТЬNULL(ШтатноеРасписаниеОрганизацийСрезПоследних1.КоличествоСтавок, 0)
   КОНЕЦ КАК Расхождение,

Можно ли сделать условие не выводить нулевые значения?

ГДЕ
   ЕСТЬNULL(ШтатноеРасписаниеОрганизацийСрезПоследних.КоличествоСтавок, 0) = 0

конечно, можно. ставь свой выбор в условие где и проверяй его на 0

ну, и конструкцию ВЫБОР можно использовать в секции ГДК, только лучше не надо

*ГДЕ

(0)А при чем тут СКД?
Может не в тему, а может пригодится: http://infostart.ru/public/185880/

получилось так

ГДЕ
   ШтатноеРасписаниеОрганизацийСрезПоследних1.Период МЕЖДУ &НачПериода И &КонПериода
   И ВЫБОР
           КОГДА ЕСТЬNULL(ШтатноеРасписаниеОрганизацийСрезПоследних1.КоличествоСтавок, 0) - ЕСТЬNULL(ШтатноеРасписаниеОрганизацийСрезПоследних.КоличествоСтавок, 0) > 0
               ТОГДА ЕСТЬNULL(ШтатноеРасписаниеОрганизацийСрезПоследних1.КоличествоСтавок, 0) - ЕСТЬNULL(ШтатноеРасписаниеОрганизацийСрезПоследних.КоличествоСтавок, 0)
           ИНАЧЕ ЕСТЬNULL(ШтатноеРасписаниеОрганизацийСрезПоследних.КоличествоСтавок, 0) - ЕСТЬNULL(ШтатноеРасписаниеОрганизацийСрезПоследних1.КоличествоСтавок, 0)
       КОНЕЦ <> 0

спс. всем.
еще вопрос до кучи.
В условном оформлении можно задавать ширину колонки, как задать ширину у колонки с порядковым номеров (СистемноеПоле)?
Ширина не меняется потому, как я понял, из-за того что есть выше группировка.

(7) нарисуй свой макет, если не нравится как СКД оформляет

Отчет в консоле выдает таблицу, на печформу ничего не выводит. В чем может быть причина?