Из категории сам не знаю, что хочу...

Есть справочник, где элементы могут ссылаться на элементы этого же справочника т.е один элемент является ссылкой на другой элемент. Что-то на подобии иерархии.  

Теперь хочу представить всю эту кашу в виде графа.
Как можно быстро в нарисовать граф в 1C?

Эмм..Ссылка она сама на себя ссылается

Эм... ну если нужна связь с элементами справочника то можно обдумать вариант СКД)) понятия не имею как))) диаграмму как-нибудь натянуть на это дело?)
Если не быстро - то HTML

А если не нужна связь с элементами, то 1С и вовсе  нипричем, в пейнте и то проще)

http://habrahabr.ru/company/infostart/blog/216113/

мне надо построить примерно это
http://its.1c.ru/db/content/v83doc/src/документация/руководство%20разработчика/_img/img00301.gif?1418831229

а вот например http://infostart.ru/public/190199/
там данные выгружаются в yED, судя по описанию занятная штука

Как можно программно построить схему в visual studio? Есть для этого какие-то методы

Когда-то я нечто подобное для Visio рисовал... Автомагически...
но никому это ни в * не упёрлось, поэтому заглохло.