В БП 3.0.40 в документе Поступление в лизинг на форме было выведено вместо с Суммой и СуммаНУ.
В БП 3.0.42 СуммаНУ пропала из формы, хоть и осталась в реквизитах. И в проводках она перестала участвовать.

Бухи хотя принять товар в лизинг разными суммами по БУ и НУ. Как  это сделать?

рукопашными операциями?

(0) Все зависит от того как заключен договор лизинга. Если договор не предусматривает иное отражение НУ, то и в документ ничего писать не надо.