В журнале есть возможность использовать режим "Изменить время документа", таким образом пользователи могу выбрать любое время.

Как проконтроллировать, чтобы нельзя было установить время больше текущего ?

ПРоцедура ПриИзмененииВремениДокумента(Док) можно прописав там СтатусВозврата(0) запретить изменение

но Док.ПолучитьВремя(Часы, Минуты, Секунды);
показывает время документа до изменения, а на какое переносится неизвестно...

(0) ну, можно перехватить в перехватчике, выполнить оригинальное событие, посмотреть время, если не устраивает - отмена.