То есть после обновления нужно сравнить основную конфигурацию со старой конфигурацией?

Сначала выявляют дописки. Потом обновляют. Потом вносят те дописки, которые не потеряли актуальность.

(1) так делают только если конфа почти типовая и имеет минимум дописок.

(2) прогнать все тесты (юнит, функциональные, интеграционные...)

(1) (2)  Спасибо за информацию.