в ут 11.3 создан документ "заказ клиента" в нем прописано индивидуальное соглашения, где указанны этапы оплаты
-до обеспечения, допустим 10 процентов
-до отгрузки, допустим 90 процентов
Делаю по первой оплате документ "счет на оплату покупателю" в нем нужно оплатить первые 10 процентов, после чего захожу в приходно кассовые ордера, раздел к поступлению, а данного счета нет, но присутствует полностью заказ, где указанна полная сумма
что забыл выставить в настройках, чтобы отображался счет?

ну так зайди в конфигуратор и посмотри "приходно кассовые ордера, раздел к поступлению". какой там запрос?

ну и вопрос с другой стороны баррикад - а почему ты решил что оно должно отображать сумму по счету?