При обновлении ошибка
ругается на документ из такого запроса:

ВЫБРАТЬ
    ТаблицаИзменений.Регистратор КАК Ссылка
ИЗ
    РегистрСведений.СуммыДокументовВВалютеРегл.Изменения КАК ТаблицаИзменений
ГДЕ
        ТаблицаИзменений.Узел В (&Узлы)
    И ИСТИНА

Т.е. знаю узел и док
Так не получается
ПланыОбмена.УдалитьРегистрациюИзменений(Узел,Док);

т.е. надо чтобы результат запроса был пустой

набор записей по РС тоже засылал с установкой отбора по доку не удалилось.
Так удалилось
ПланыОбмена.УдалитьРегистрациюИзменений(Узел);
на копии базы и так проблему решил. надеюсь что в рабочей такой ситуации не возникнет

ПланыОбмена.УдалитьРегистрациюИзменений(Узел);

Тихо сам с собою... В типовых есть обработка "Регистрация изменений..." В ней можно аккуратно убрать, добавить и т.д.