Подскажите кто знает
Как вести учет отпуков в УНФ и как отследить кто был в отпуске или нет?

емнип, никак

(1) в УНФ какой ни будь модуль нельзя добавить?

(2) почему нельзя? добавляйте хоть миллион модулей

(3) подцепить можно все, что угодно, но хочется дополнить УНФ для оптимального учета отпусков

(4) Добавь из ЗУП

НУ там есть ресурсы, которым можно привязать сотрудников, а у ресурсов есть график работы, где можно отражать отпуска, как не рабочее время) И есть обработка где эти графики можно смотреть

(4) ну вот же, сам всё знаешь.
осталось взять и написать

(4) "оптимального учета отпусков"
Я извиняюсь, что значит оптимального?

(8) может есть типовое расширение для УНФ по зарплате